función de onda Spartan 10 v1.1.0 para Mac OS X | 586 MB
Spartan de la función de onda es una herramienta de modelado de propósito general que usa los métodos modernos de cálculo para proporcionar a los investigadores con datos cuantitativos sobre una estructura molecular, la energía, la reactividad, la selectividad y una amplia gama de propiedades moleculares. Con una única GUI (interfaz gráfica de usuario)/motor computacional espartano ofrece a los usuarios una herramienta de modelado molecular, que es a la vez completa y fácil de usar. Con la visualización insuperable y una amplia gama de métodos computacionales bien documentada en una única herramienta de software fácil de usar, Spartan ofrece toda la potencia de modelado molecular para los químicos en todas partes.

Modelado molecular y visualización

Spartan combina un potente conjunto de modelado molecular y herramientas de cálculo en una interfaz gráfica de usuario. Con este único e integrado, fácil de usar interfaz gráfica de usuario es fácil construir/importación y aumentar las moléculas y los sistemas de ejecución de mecánica molecular y cálculos de química cuántica, y analizar los resultados con gráficos Spartan, cuadros de diálogo de propiedades, hojas de cálculo integradas, datos y gráficos de espectros, y el texto de salida.

La superficie de visualización
Superficies moleculares se puede calcular a partir de una amplia gama de métodos de construir la química cuántica. Esto proporciona vínculos esenciales entre los observables importante sustancia química - estructura, la estabilidad, la reactividad y la selectividad - y la energía. Spartan tiene la capacidad de calcular las propiedades de la superficie de varias moléculas. Esto puede ayudar en los cálculos de equilibrio molecular y la geometría del estado de transición, así como los datos termodinámicos y cinéticos como una continuación de la interpretación de las superficies.

ChemDraw Integración
Spartan puede usar ChemDraw como constructor de modelos moleculares para la generación de modelos en 2D inicial dentro de Spartan. Visualización avanzada Spartan y conjunto de funciones de cálculo puede desarrollar estos modelos utilizando técnicas de vanguardia Química Cuántica. Integración con Spartan CambridgeSoft ChemDraw.

Base de datos Access
Spartan incluye el acceso a una serie de modelos moleculares de gran utilidad y bases de datos de estructura, incluyendo: La base de datos Spartan Molecular, bases de datos de reacción Spartan, la base de datos estructurales de Cambridge (licencia por separado), NIST IR y RMN de base de datos experimental de la Universidad de Colonia, base de datos de RMN y el Banco de Datos de Proteínas (vía Internet).

Spartan bases de datos

PDB (Protein Data Bank) Base de datos
Spartan proporciona un enlace con el AP (Protein Data Bank). Los usuarios pueden recuperar (en base a AP ID) entradas de RCSB AP (siempre que su ordenador está conectado a Internet actual). El Protein Data Bank cuenta con más de 30.000 rayos X de cristales y estructuras de RMN de proteínas y ácidos nucleicos.

Spartan Molecular de la base de datos (SMD)
Spartan Molecular de la base de datos (DEP) para calcular las estructuras y propiedades:

     Búsqueda exacta y la subestructura de más de 140.000 moléculas
     Nombre, Fórmula, Peso y el isómero búsqueda
     Incluye más de 40.000 espectros IR, más de 20.000 espectros de RMN y 2000 UV/vis espectros
     Con más de 1.200 moléculas unidas a proteínas/nucleótidos de la AP (Protein Data Bank)


Base de datos de reacción Spartan
Spartan ofrece la base de datos de reacción espartana que tiene una búsqueda de subestructuras de más de 1.500 reacciones orgánicos y organometálicos con detalles sobre los estados de transición y moléculas espectros IR. También ofrece estimaciones iniciales de la estructura para el cálculo de la geometría del estado de transición.

Cambridge Structural Database (CSD)
Accede a la base de datos estructurales de Cambridge (CDS) * de más de 300.000 estructuras experimentales de cristal de rayos X para las moléculas orgánicas y organometálicas, junto con sus referencias de la literatura. Spartan opcionalmente añade hidrógenos y refina las posiciones de hidrógeno.

* El acceso a la base de datos estructurales de Cambridge (CSD) debe tener una licencia por separado.

NIST Experimental de bases de datos
Si su ordenador está conectado a Internet, * Spartan puede retieve y parcela experimental espectros IR (~ 14.000 moléculas) y espectros de UV/Vis (~ 1500) del NIST experimental espectros IR de bases de datos y NIST UV experimental/base de datos de espectros vis
Universidad de Colonia, base de datos de RMN

Si su ordenador está conectado a Internet, * Spartan puede retieve y parcela experimental desplazamientos químicos de RMN (~ 15.000 moléculas) de la Universidad de Colonia, base de datos de RMN.

* El acceso a la universidad de Colonia, base de datos de RMN es sólo disponible en Spartan

Controles intuitivos para la Modelización Molecular rápida:

     Orgánica: Llamada a un constructor de común fragmentos orgánicos (por ejemplo, "sp3 de carbono"), grupos funcionales y anillos para la fácil construcción de moléculas orgánicas.
     Inorgánicos: Se extiende a lo largo de la construcción de la tabla periódica completa. Incluye grupos, anillos y una biblioteca de ligandos comunes.
     Péptido: Llamada a un constructor con los aminoácidos para la construcción de polipéptidos como hélices, hojas o en conformaciones definidas por el usuario.
     Nucleótidos: Llamada a un constructor de bases de nucleótidos para la construcción de ADN de cadena sencilla o doble o ARN como hélices A o B o definidos por el usuario conformaciones.
     Sustituyente: Un nuevo constructor para la generación de grupos de moléculas sustituido.
     Edificio 2D: Nuevo acceso sin fisuras a 2-D a través de la construcción de ChemDraw (necesaria una autorización por separado de CambridgeSoft).
     Personalizado: Obtener acceso a una biblioteca incluida (y personalizables) de grupos funcionales adicionales, los anillos y los ligandos.
     Portapapeles: El acceso a cualquier molécula o fragmento molecular que ha sido previamente construido.
     Importación: Spartan, MOL y Sybyl MOL2, AP, MacroModel, sonrisas, XYZ, SDF, TGF, SKC, CIF, y los archivos de CDX.
     Exportación: Spartan, MOL y Sybyl MOL2, AP, MacroModel, sonrisas, y los archivos XYZ molécula, gráficos como JPG, PNG, y BMP, animaciones como archivos AVI.


Química Cuántica

Spartan usando métodos modernos de cálculo puede calcular muchas de las propiedades moleculares. La filosofía espartana ha sido la de concentrarse y poner de relieve una lista bien establecida de los métodos de cálculo "estándar" y documentar rigurosamente el rendimiento de estos métodos con datos experimentales.

El cálculo general
La lista completa de los cálculos de Esparta ofrece un resumen útil de los muchos métodos de cálculo y sub-opciones que incorpora Spartan. En el interior espartano estos métodos son fáciles de seleccionar y aplicar.

Semi-empíricos de los orbitales moleculares
Semi-empíricos modelos son los más simples de los sistemas químicos cuánticos, y son útiles para los cálculos de estructura y equilibrio del estado de transición. PM3, en particular, ha demostrado ser una herramienta fiable para el cálculo de la geometría de los compuestos de metales de transición inorgánicos y organometálicos.

Hartree Fock
En la física computacional y la química computacional, la Hartree Fock (HF) es un método de aproximada para la determinación de la función de onda del estado fundamental y el estado fundamental de energía de un cuanto sistema de muchos cuerpos. El método de Hartree Fock también se le llama, especialmente en la literatura antigua, el método del campo autoconsistente (SCF).

El método de Hartree Fock se suele utilizar para resolver la ecuación de Schrödinger independiente del tiempo de un átomo de varios electrones o molécula tal como se describe en la aproximación de Born-Oppenheimer. Dado que no existen soluciones conocidas para los sistemas de muchos electrones (átomos hidrogénicas y el catión hidrógeno diatómico siendo notables excepciones de un electrón), el problema se resuelve numéricamente. Debido a las no linealidades introducidas por la aproximación de Hartree Fock, las ecuaciones se resuelven mediante un método no lineal como la iteración, lo que da lugar al nombre de "método del campo autoconsistente". Hartree-Fock modelos son útiles para predecir la estructura de los cálculos, la energía y los bienes, en particular para las moléculas orgánicas.

Teoría funcional de la densidad
Los modelos de la teoría funcional de la densidad suelen proporcionar los resultados de una calidad comparable a los modelos convencionales de correlación, como MP2, pero a un costo sólo ligeramente mayor que la de los modelos de Hartree-Fock. Como tales, son particularmente útiles para la alta calidad de cálculos de estructura, energía y bienes, incluyendo los cálculos de los compuestos de metales de transición inorgánicos y organometálicos. Los modelos locales de la densidad y la presión arterial, BLYP, EDF1, EDF2, y los modelos de B3LYP son compatibles con los juegos de misma base y pseudopotenciales como disponibles para los modelos de Hartree-Fock.

Møller-Plesset
MP2 es quizás el modelo más simple para tener en cuenta razonable de la correlación de electrones, y por lo general ofrece una descripción precisa de la estructura de equilibrio, y la conformación energética de una variedad de reacciones químicas, incluyendo las reacciones en los enlaces químicos se rompen. Métodos de MP son compatibles con los juegos de misma base y pseudopotenciales para Hartree-Fock y la densidad de los modelos funcionales. Nueva en Spartan es el modelo RI-MP2, con resultados casi idénticos a MP2, pero con importantes mejoras de rendimiento: los cálculos de la energía de un orden de magnitud más rápido y los cálculos de la estructura de un factor de 3 veces más rápido que MP2 convencionales. Modelos de MP3 y MP4 están disponibles para los cálculos de la energía de un punto único, ya que es una variante rápida localizada orbital de MP2. Los conjuntos misma base y apoyo para pseudopotenciales Hartree-Fock están disponibles.

Estado excitado Métodos
Los cálculos de estados excitados se puede realizar utilizando la CEI, la CEI (D), y los modelos de TDDFT además de toda la gama de modelos de densidad funcional. Los conjuntos misma base y apoyo para los cálculos de pseudopotenciales estado fundamental están disponibles.

Correlación avanzada
Un gran número de orden de los modelos de correlación están disponibles para los cálculos de la energía solamente. Estos incluyen CCSD, CCSD (T), OD, OD (T), QCISD, QCISD (T), QCCD y QCCD (T) modelos, con la misma base que establece y pseudopotenciales para Hartree-Fock, la densidad funcional y Møller - Plesset cálculos.

Recetas termoquímicos
Varias recetas para la obtención de gran precisión los calores de formación están disponibles, incluyendo la receta nueva T1 que proporciona resultados en 3 kJ/mol de la (también disponible) G3 (MP2) enfoque, pero con órdenes de rendimiento de magnitud más rápido que el G3 (MP2) . Recetas adicionales incluyen G2, G3.

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